扬子晚报网11月18日讯(记者 梅建明)近日万博manbext体育官网app官网,由南京农业大学国度大豆转换中心的邢光南副透露主导并初次到手拼装和防卫了我国蹙迫经济虫豸豆天蛾基因组。这一后果,不仅让东谈主们对豆天蛾的贯穿达到了一个全新高度,也为后续了解豆天蛾发育经由中复杂的调控机制、优化豆天蛾的东谈主工繁衍本事提供了厚爱的数据资源。
图为本年暑假期间,邢光南副透露与学生在田间交流斟酌豆天蛾繁衍专用品种筛选圭臬
据先容,豆天蛾,其幼虫笔名豆丹,原是农民口中所称的危害大豆的大青虫、大害虫。然则,因豆天蛾养分价值高,含有多种东谈主体必需氨基酸,可看成优质卵白开首。跟着经济发展以及东谈主们对健康饮食的珍藏,豆天蛾需求越发隆盛,其东谈主工繁衍也快速兴起,并已成为江苏连云港等地区的蹙迫好意思食。
图为豆天蛾基因组特色
邢光南副透露告诉扬子晚报紫牛新闻记者,在推测中,他萌生了探索豆天蛾基因组的方针。2023年10月,他率领颜宇璐等推测生团队启动了豆天蛾基因组拼装、防卫的使命。团队相聚了五龄豆天蛾幼虫,用作基因组测序拼装的实验对象。通过不时PacBio HiFi、Hi-C本事,初次拼装了豆天蛾高质料染色体水平基因组。拼装的基因组大小为477.45百万碱基对(Mb),contig N50为17.43 Mb。经过Hi-C搭建后,contigs被拼装到29条染色体上,挂载率为99.61%。该基因组通用单拷贝同源基因基准好意思满性为99.49%,意味着险些统统的蹙迫基因齐如故被正确识别。基因组包含252.16 Mb的交流元件和14,214个卵白质编码基因。这些信息关于贯穿豆天蛾的生物学特色至关蹙迫。通过比拟豆天蛾与香烟天蛾的基因组发现两者具有很强的共线性,香烟天蛾28号染色体与豆天蛾15号和29号染色体之间发生过染色体间永诀或交融。而比拟豆天蛾与家蚕的基因组,发现豆天蛾染色体与家蚕染色体共线性进度较低,即染色体间交融和断裂的自尊更相似。
此外,该推测团队还防卫了一条环化且好意思满的线粒体基因组序列,长度为15,417 bp。线粒体是细胞的能量工场,这条好意思满的线粒体基因组为推测豆天蛾的能量代谢提供了蹙迫陈迹。该文发表于Scientific Data. 2024, 11: 1062。本次拼装的豆天蛾基因组,将为豆天蛾的深化推测,以及豆天蛾繁衍本事的优化提供新想路、新决策。该课题组前期推测顺序 知道春播高感大豆品种南农89-29,耕种密度1万株/亩,在大豆V6期挂卵,挂卵密度1.7万粒/亩,可取得豆天蛾幼虫产量174斤/亩。
图为从外环到内环顺次知道的是染色体长度散布、GC含量、基因密度以及转座元件(DNA转座子、SINE、LINE和LTR)的散布
不久前,在邢透露等众人的指挥下,南京农业大学农学院学生石一涵等组建了豆天蛾暑期社会执行团,赴淮安、连云港等地围绕豆天蛾繁衍情况张开执行调研,为科罚豆天蛾东谈主工繁衍中的难养、低产问题提倡科罚圭臬,积极促进当地关系产业的健康发展。
校对 陶善工万博manbext体育官网app官网